Исследователи оспаривают громкие выводы о раковых микробах

Три исследования, опубликованные в престижных журналах, показали, что опухоли усеяны микробами. Но нескольким командам не удалось повторить эту работу.

За последние несколько лет многие исследования показали, что опухоли содержат удивительно богатый набор бактерий, грибов и вирусов. Эти поразительные открытия заставили многих ученых переосмыслить природу рака.

Медицинские возможности были захватывающими: если опухоли выделяют в кровоток свои отличительные микробы, могут ли они служить ранний маркер заболевания? Или антибиотики могут даже уменьшить опухоли?

В 2019 году стартап опирался на эти результаты для разработки микробных тестов на рак. В этом году регулирующие органы согласились сделать приоритетным предстоящее испытание теста компании из-за его обещания спасти жизни.

Но теперь несколько исследовательских групп поставили под сомнение три наиболее известных исследования в поле, сообщив, что им не удалось воспроизвести результаты. Критики заявили, что предполагаемые опухолевые микробы, скорее всего, были миражами или результатом заражения.

"Они просто нашли то, чего не было", - сказал Стивен Зальцберг, эксперт в анализе последовательности ДНК в Университете Джонса Хопкинса, который опубликовал один из недавних обзоров.

Авторы книги защитили свои данные и указали на более поздние исследования, которые достигли аналогичных результатов. выводы. Продолжающиеся дебаты показывают противоречие между потенциально мощными приложениями, которые могут возникнуть в результате понимания опухолевых микробов, и проблемой расшифровки их истинной природы. Независимые эксперты говорят, что нынешний спор является примером растущих трудностей в молодой, но многообещающей области.

Биологам уже несколько десятилетий известно, что по крайней мере некоторые микробы играют роль в возникновении рака. . . Наиболее ярким примером является вирус ВПЧ, который вызывает рак шейки матки, заражая клетки. А некоторые штаммы бактерий вызывают другие виды рака в органах, таких как кишечник и желудок.

В течение десятилетий эти связи выявлялись медленно, поскольку ученым не хватало большей части технологий. . доступен сегодня. Исследования резко ускорились, когда исследователи научились извлекать фрагменты ДНК из опухолей. Затем они использовали компьютеры, чтобы определить, произошел ли генетический материал из клеток человека или других видов.

В 2019 году группа ученых медицинского факультета Нью-Йоркского университета использовала эти методы в исследовании рака поджелудочной железы, опубликованном в журнале Nature. Во многих опухолях они обнаружили фрагменты ДНК нескольких разных видов грибов. Дальнейшие исследования привели их к выводу, что причиной роста опухолей являются грибки.

Эти поразительные результаты привлекли внимание доктора Питера Аллена, хирурга из Университета Дьюка. Медицинский факультет, который начал поиск микробов в опухолях поджелудочной железы собственных пациентов.

Но после поиска 140 опухолей доктор не смог найти осмысленного ответа. количество ДНК всех микробов, включая грибы. «Мы не смогли найти никаких реальных сигнатур», — сказал он.

Затем они просмотрели исходное исследование, генетические данные которого были загружены в общедоступную базу данных. Команда доктора Аллена также не смогла обнаружить в этих данных заметного количества грибковой ДНК. Они опубликовали свои результаты в журнале Nature 2 августа.

Исследователи Нью-Йоркского университета защитили свою работу. «Моя группа придерживается того, что мы обнаружили», — сказал Дипак Саксена, один из авторов первоначального исследования. Он указал на другие данные, согласующиеся с его выводами.

Например, в августе исследователи из Токийского медицинского и стоматологического университета сообщили об обнаружении грибков в опухолях поджелудочной железы в 78 из 78 случаев. чел., 180 больных. А пациенты с опухолями, содержащими грибки, подвергались большему риску смерти...